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Qué no se sabe todavía
La parte del trabajo que no suele enseñarse. Setenta y tres preguntas siguen abiertas en el cuaderno del grupo, y algunas enfrentan dos resultados propios que no pueden ser ciertos a la vez.
Qué se sabe
Que no sabemos bastante, y dónde exactamente. Estas son las preguntas que hoy decidirían el rumbo del trabajo si alguien las contestara:
- ¿El potencial de la membrana mitocondrial sube o baja cuando falta GDAP1? La hipótesis que el grupo quiere poner a prueba depende del signo, y la literatura está en los dos ladosabierto1.
- ¿La red mitocondrial se fragmenta o se hace tubular? Tres fuentes apuntan a sitios distintos, y el manuscrito que tiene las imágenes no cuantifica la morfología ni una sola vezabierto2.
- ¿Qué fenotipo se mide si cuatro de las seis dianas no se expresan en la célula de partidaabierto3?
- ¿Puede un cambio silencioso romper el sitio de corte y empalme que tiene al lado? Si lo rompe, el modelo sería de otra enfermedad distinta de la que se quiere modelarabierto4.
- ¿La variante de HSPB1 destruye por sí sola la secuencia que la maquinaria reconoceabierto5?
- Dos sitios parecidos del genoma se escapan del barrido por el tipo de desajuste que tienen, y uno cae dentro de un genabierto6.
Cómo se sabelas fuentes y el método
Porque están escritas. Cuando dos resultados del grupo se contradicen, la casa obliga a abrir una pregunta y enlazarla desde los dos lados, en vez de resolverla en silencio. Tres que siguen vivas:
- Autofagia sí, mitofagia no. El eje de reciclaje sube de forma consistente7, pero al medir mitofagia en sentido estricto la señal se cae8. Las dos cosas están medidas sobre los mismos datos.
- La firma oxidativa depende del sistema de medida. Hay un aumento medido en la línea de pacienteprovisional9, y a la vez la conclusión de que la respuesta cambia según cómo se mida10.
- Un resultado que el grupo refutó sigue impreso. La acumulación celular en una fase concreta del ciclo se dio por falsa tras el reanálisisrefutado11, y aun así el manuscrito en circulación la reafirma12.
Qué está en dudalo abierto, sin maquillar
Hasta las dudas tienen dudas. No está claro que los valores de significación del reanálisis se puedan leer como tasas de error, en vez de como una simple ordenación de candidatosabierto13. Y si los ejes mitocondrial y axonal están acoplados, los datos públicos no lo pueden contestarabierto14.
El marco que acota todo lo anterior es una sola frase del propio cuaderno: ningún dato de fenotipo tiene repetición independiente suficiente para una prueba15. Lo que hay son indicios ordenados y un método para no engañarse con ellos.
En qué se apoya esta página (15)
- 1Sin GDAP1, ¿el potencial de membrana mitocondrial sube o baja?abiertopmc.ncbi.nlm.nih.gov · pmc.ncbi.nlm.nih.gov
- 2Sin GDAP1, ¿la red mitocondrial se fragmenta o se hace tubular? ¿Y por qué no se ha medido aquí?abierto
- 3¿Qué fenotipo se espera medir, si cuatro de los seis genes no se expresan en la hiPSC?abierto
- 4La variante de GARS1 cae a 1-2 nt del donante de splicing, así que un cambio silencioso al lado puede romperloabierto
- 5En HSPB1 el PAM coincide con la propia posición patogénica, y hay que destruirlo sin dejar de instalar la mutaciónabierto
- 6Dos off-targets con bulge identificados en generación 1 no están en ninguna Lista Aabierto
- 7La autofagia es el único eje que sobrevive a corrección estrictafirme · evidencia reanalisis
- 8Medida de verdad, la mitofagia no se sostiene: el eje es autofagia generalfirme · evidencia reanalisis
- 9La línea GDAP1 de paciente tiene más señal CellROX (28,07 → 60,79 u.a., por imagen)provisional · evidencia experimental
- 10La firma oxidativa depende del sistema celular y no sobrevive a corrección múltiplefirme · evidencia reanalisis
- 11La línea GDAP1 de paciente acumula células en G2/M (16,0 % → 20,55 %)refutado · evidencia experimental
- 12El manuscrito nuevo reafirma la acumulación en G2/M que el propio grupo refutó dos semanas antesfirme · evidencia reanalisis
- 13¿Los p del reanálisis son tasas de error, o sólo una ordenación? El Bonferroni de las ~70 pruebas está en dudaabierto
- 14¿Hay relación entre disfunción mitocondrial y vulnerabilidad axonal? No con estos datosabierto
- 15Ningún dato de fenotipo tiene repetición independiente suficiente para una pruebafirme · evidencia tfm